Buena pregunta karen, herramientas seo hay muchas, todas las que quieras y para realizar todo tipo de tareas. Lo mejor es que cada uno encuentre las que más le gusten, o incluso se las haga cada uno. Si quieres empezar por una, la primera sería la de herramientas para webmasters de google, con ella puedes controlar todo el tema de enlaces e indexaciones.

A partir de ahí, todas las que quieras.